在生理学上将除草剂对杂草专杀的特性称之为除草剂的选择性。一般来讲，除草剂对所有作物均具有一定的毒害程度，不同的是，各种作物对除草剂的耐受能力差异有别，可以说就是具备除草剂抗性的作物，天天除草剂浸泡一下，可能也活不下去。下面对除草剂的选择性原理做一下解释：
除草剂的选择性是我们根据植物及除草剂的某些特性而开发的，利用植物的形态特征、生理生化差异、生长期差异、遗传学差异等特点，从而实现除草剂的选择特性。根据除草剂的不同特性我们将除草剂的选择性可分：形态选择、生理生化选择、时差选择、位差选择、人为选择等，下面分别介绍一下。
各类农作物的形态结构和内部结构性差异，是该类除草剂形成选择的依据。比如玉米、小麦这类禾本科作物，其叶子表面光滑，而像大豆、西红柿叶子较大表面较粗糙。这种形态上的差异性就是我们可以利用的选择依据。小麦、水稻、玉米之类的作物喷洒在叶面的药剂易于滚落，不利于药剂的吸收和渗入。而其他阔叶型杂草，不具备这种特性，因而就会吸收而被杀灭。
不同农作物对除草剂的吸收和传导有着很大的差别，因此，不同农作物对于除草剂的表现也就有很大的差异，这就形成了对除草剂的生理生化选择性。如2，4-D、二甲四氯等除草剂，能被双子叶植物很快吸收，并向植株各部位转送，造成中毒死亡。再比如幼小比年老、生长慢的作物对除草剂更了敏感，易于杀死。
这种时差性选择是利用了作物的播种与出苗的时间差，从而实现消灭杂草的目的。比如种植的大蒜，在大蒜播种后未出苗前，进行喷施广谱除草剂，将地面的杂草杀死，由于此类除草剂的药效迅速、残留期短，大蒜发芽之后并不影响正常生长。
一些土壤型除草剂，通过利用根系在土壤中分布的深浅差异，来实现对杂草的杀灭作用，称之为位差选择。例如溶解度小而吸附性强的除草醚、拉索、敌草隆、利谷隆等除草剂，易吸附地表而形成药膜层，杀死表土层0-2厘米处的小粒种子的杂草，而对玉米、棉花、大豆等农作物安全，因为这些农作物播种深度5厘米左右，根系分布也深。
在农作物比杂草普遍高的田地中，可以在农作物生长到一定阶段后，，定向的喷施除草剂，这种情况对杂草的防治效果比较好。这种定向性的喷施，对作物的损害不会大，对防治杂草的效果却很好。
田间除草剂的选用，还是要根据杂草类型，正确依照说明书谨慎选择使用，了解透彻除草剂的选择性原理，争取选择除草剂，才能高效除草。不过任何除草剂都不是无毒的，在使用之时，也需要做好自我保护，谨防中毒事件。
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